Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H3f3aP84244 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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