Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx1P81068 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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