Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms