Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms