Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkn1P70268 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkn1P70268 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms