Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf5P70191 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf5P70191 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf5P70191 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms