Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn5P68500 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms