Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms