Protein–RNA interactions for Protein: P63239

Pcsk1, Neuroendocrine convertase 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1P63239 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pcsk1P63239 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pcsk1P63239 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pcsk1P63239 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pcsk1P63239 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pcsk1P63239 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pcsk1P63239 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pcsk1P63239 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pcsk1P63239 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pcsk1P63239 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms