Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lhx1P63006 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx1P63006 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms