Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Vbp1P61759 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Vbp1P61759 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Vbp1P61759 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Vbp1P61759 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Vbp1P61759 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Vbp1P61759 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Vbp1P61759 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Vbp1P61759 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vbp1P61759 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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