Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms