Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms