Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Csrnp3P59055 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csrnp3P59055 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms