Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa1P58281 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa1P58281 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa1P58281 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa1P58281 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Opa1P58281 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opa1P58281 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa1P58281 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opa1P58281 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms