Protein–RNA interactions for Protein: P58064

Mrps6, 28S ribosomal protein S6, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps6P58064 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrps6P58064 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrps6P58064 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrps6P58064 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrps6P58064 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrps6P58064 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrps6P58064 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrps6P58064 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrps6P58064 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrps6P58064 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrps6P58064 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrps6P58064 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrps6P58064 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrps6P58064 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrps6P58064 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrps6P58064 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrps6P58064 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrps6P58064 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrps6P58064 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrps6P58064 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrps6P58064 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mrps6P58064 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms