Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms