Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms