Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms