Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TdgP56581 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TdgP56581 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TdgP56581 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TdgP56581 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TdgP56581 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TdgP56581 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TdgP56581 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TdgP56581 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TdgP56581 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TdgP56581 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TdgP56581 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TdgP56581 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TdgP56581 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TdgP56581 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TdgP56581 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TdgP56581 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms