Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lim2P56563 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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