Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrlP54846 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrlP54846 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrlP54846 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms