Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nub1P54729 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nub1P54729 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nub1P54729 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms