Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms