Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms