Protein–RNA interactions for Protein: P51410

Rpl9, 60S ribosomal protein L9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9P51410 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl9P51410 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms