Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TspoP50637 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
TspoP50637 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TspoP50637 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TspoP50637 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms