Protein–RNA interactions for Protein: P50428

Arsa, Arylsulfatase A, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArsaP50428 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ArsaP50428 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms