Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms