Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cav1P49817 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cav1P49817 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cav1P49817 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms