Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LmnaP48678 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms