Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx2P48379 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms