Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfaP48030 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TgfaP48030 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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