Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms