Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Resp18P47939 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms