Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rph3aP47708 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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