Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsf4P43488 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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