Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Sdc2P43407 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdc2P43407 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdc2P43407 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdc2P43407 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Sdc2P43407 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Sdc2P43407 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdc2P43407 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdc2P43407 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdc2P43407 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Sdc2P43407 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Sdc2P43407 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc2P43407 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc2P43407 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Sdc2P43407 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Sdc2P43407 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc2P43407 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Sdc2P43407 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc2P43407 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Sdc2P43407 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc2P43407 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc2P43407 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc2P43407 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc2P43407 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc2P43407 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc2P43407 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc2P43407 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc2P43407 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc2P43407 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Sdc2P43407 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc2P43407 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc2P43407 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc2P43407 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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