Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept1P42209 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms