Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl28P41105 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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