Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ighmbp2P40694 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighmbp2P40694 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms