Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6dP35459 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms