Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apoc1P34928 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apoc1P34928 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apoc1P34928 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apoc1P34928 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apoc1P34928 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apoc1P34928 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apoc1P34928 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apoc1P34928 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apoc1P34928 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apoc1P34928 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apoc1P34928 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apoc1P34928 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apoc1P34928 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apoc1P34928 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apoc1P34928 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apoc1P34928 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms