Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp13P33435 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms