Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms