Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc11P31313 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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