Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp2P29594 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp2P29594 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp2P29594 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casp2P29594 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp2P29594 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms