Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc1P29341 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms