Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprmP28828 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprmP28828 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprmP28828 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprmP28828 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprmP28828 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprmP28828 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprmP28828 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprmP28828 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprmP28828 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprmP28828 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms