Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa3P28310 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa3P28310 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa3P28310 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa3P28310 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms